土牛年(1949年),五月赴查里寺,主持安曲仁波且的转世登席继位。八月十五日起,应故乡辖美之请,传授时轮大灌顶(第三次)。九月二十二日,与萨木察仓一同主持,奉迎德赤,图丹嘉措入寺登席。彼时,外国传教士劝其出国,大师坚拒。闻讯解放军已抵河州(今临夏回族自治州),敦促佐盖土司前去接洽。
铁虎年(1950年),为解决查里寺僧人饮水之难,大师设计用竹筒将山上泉水引入净厨,由此,持棍跛行者大减。
铁兔年(1951年),拉卜楞寺六大学院执事、亲王府、各部落共同推举,由大师主持迎请班禅前来认定嘉木样转世。三月初三日,在西宁向班禅大师呈送报告。十月初一日,班禅大师在拉卜楞经堂前世灵塔前确定转世(第六世)。年底,赴京出席全国民族工作扩大会议。在西安初次会见碌奔·喜饶嘉措大师,习仲勋设宴招待。在会上,大师就民族平等龟民族区域自治、宗教信仰自由和保护寺院作了发言。(左图:第六世贡唐活佛着法衣相)
水龙年(1952年)二月十一日,第六世嘉木样登席继位,大师献上丰厚礼品。夏,因四川黑水地区尚未解放,游勇散卒四处骚扰,大师前往松潘、茂汶、汶川等地,向各土司多次宣传争取和平解放的好处。在马尔康受到天宝等四川省军政领导的接待和赞扬。
水蛇年(1953年),在噶科的柳林中搭帐房养息,并修建一房,赐名"丹达林"(四川红原县)。
木马年(1954年),根据嘉木样大师的谕示,拉卜楞寺僧众大会派代表尕藏等到丹达林,敦请大师出任总法台,大师允准。神降节,正式履任拉卜楞寺第八十五任总法台。任期内,大师除主持日常经会、教务外,还广为布施,改善僧人学经生活条件。其时,拉卜楞寺僧侣三千,活佛、格西云集,施主人财两旺,贡唐拉章也十分兴盛。
木羊年(1955年),第十四世达赖喇嘛丹增嘉措首次莅临拉卜楞寺,传授大悲观世音灌顶。后,班禅大师莅寺。传授独雄大威德灌顶。九月十九日,经师毛尔盖·图丹嘉措圆寂。大师悲痛莫名,举行盛大祭供。
火猴年(1956年),八月十五日起,应青海河南蒙旗达参部(今赛龙乡)之请,在塘嘉高传授时轮大灌顶(第四次),三省二十一县的僧俗万人参加法会。针对当时三省边界地区不靖,大师宣讲国泰民安之理。夏,在噶科洛发现一药水泉,并为之开光,被称为"贡唐药泉"。(右图:贡唐仁波切在法台上)
火鸡年(1957年),应卓尼车巴沟等僧俗之请,从三月十五日起,向热丹嘉措为首的僧俗信众万人传授时轮大灌顶(第五次)。秋,辞去总法台之职,前往查里寺。在噶科基本建成贡唐和平乳品厂和小学。是年,大师的诗学著作在佐盖新寺刻出。
土狗年(1958年)春节,大师主持编导、上演丹贝仲美著的《琅吉惹哇王传》,对戏剧艺术有所创新。二月十五日起,根据原来之请向安曲查里寺僧俗信众一万多人传授时轮大灌顶(第六次)。当时,有人奉劝大师出国,大师不为所动。后接到四川省"请来成都有事相商"的通知,启程前往,沿途朝礼峨嵋山普贤菩萨的道场。旧历四月初八(5月22日)夜半在成都被捕。后贡唐拉章也驻进工作组,大师被定为"反革命分子",所有财产充公。四月,从成都由火车押送至兰州城内监狱,后移往大沙坪监狱。土鸡年(1969年)三月,被送到平凉监狱。
从土狗年四月至土羊年(1979年)三月,在狱中度过二十一个春秋。其间,大师除学习汉语汉文外,还阅读政治著作,学习制鞋、修理、图案设计等技术。
土羊年(1979年)四月十三日获释。回合作小住后,四月二十日起,同黄正清等老干部一道前往成都、重庆、武汉、井岗山、杭州、上海、南京等地参观。年底,被选为甘肃省政协常委。后,甘肃省高级人民法院宣布他无罪,予以彻底平反。
铁猴年(1980)公历三月三十一日到拉卜楞寺,在曼巴扎仓经堂接受朝拜,朝礼所余圣物。后。前往桑科、科才、博拉、阿木去乎、扎油、佐盖等地,沿途接受群众朝拜。反复宣讲办学读书的重要,并向十所学校捐资万元。九月,班禅大师视察拉卜楞寺,委任大师为寺管会主任。
铁鸡年(1981年),在成都度过藏历新年,后回拉卜楞寺为二百多位活佛和僧人划分宅基地,研究文物保护和佛殿维修事宜。甘南党政领导向省上请示,省上动员大师协助各级政府调解卓尼与佐盖、科才与青海河南蒙古自治县赛龙乡等的边界纠纷。冬,被选为全国政协委员。
水狗年(1982年)秋,赴川调解草山纠纷。七月初二日,在交界处,大师对云集的信众宣讲社会稳定、地方太平之理。九月二十三日,班禅大师莅临拉卜楞寺,大师汇报两年管护寺院情况,举荐嘉木样大师出任寺管会主任,陪同班禅大师视察甘南7县、阿坝州若尔盖、红原、马尔康、理县等,送至成都。
水猪年(1983年)七月,参加调解青海河南蒙县外斯与甘肃玛曲佐盖尼玛的边界争议。主持欧拉寺开放仪式。在熙美朵塘捐助学校牧场基金。
木鼠年("84年)三月,政协甘肃省五届三次会议上被选为副主席。应一些寺院和村庄之请传授灌顶,教敕,随许。
木牛年(1985年)四月,闻迅拉卜楞寺大经堂失火,迅速赶来,与嘉木样大师一同将历世上师的骨灰奉迎至图丹颇章佛宫。后赴京汇报,国家决定拨款修复大经堂,由二位大师主持其事。七月,出任拉卜楞寺大经堂修复委员会副主任。十月,赴藏考察佛殿建筑,朝礼各圣迹,特地去哲蚌寺郭莽扎仓夏扎康村、蔡贡唐寺瞻仰、礼供。在甘丹寺讲经传法合后抵札什伦布寺,向班禅大师请授长寿灌顶。朝拜大昭寺和三大寺时出现多种奇兆,大师广为布施。
火虎年(1986年)八月。赴西宁参加五省区政协文史资料工作会议。十一月,任中国佛教代表团团长,赴尼泊尔首都出席世界佛教联谊会第十五次会议,朝礼佛陀诞生之地蓝毗尼园等圣地凸后经泰国、香港回京。